Muzeum Napajedla prezentuje na swoich stałych ekspozycjach nie tylko historię miasta, ale także przedsiębiorstw przemysłowych Fatra i Slavia braci Paříków. Najmłodszych zwiedzających muzeum zaprasza na Plac zabaw dla zabawek – ekspozycję, która w zabawowej formie przedstawia legendarne zabawki projektantów Libušy Niklovej i Alfréda Kluga. Muzeum organizuje także krótkookresowe wystawy w nowoczesnej sali audiowizualnej. W obiekcie Nowego Klasztoru, oprócz muzeum, odwiedzający mają do dyspozycji także Centrum informacji i kawiarnię Café Klášter. Obiekt muzeum jest w pełni dostępny dla osób niepełnosprawnych.